Tizimdagi tashkilotlar Akademik M.Mirzayev nomli bog'dorchilik, uzumchilik va vinochilik ilmiy-tadqiqot instituti. Paxta seleksiyasi, urug‘chiligi va yetishtirish agrotexnologiyalari ilmiy-tadqiqot instituti Sabzavot, poliz ekinlari va kartoshkachilik ilmiy-tadqiqot instituti Sholichilik ilmiy-tadqiqot instituti Don sholi ilmiy ishlab chiqarish birlashmasi Qoraqalpog‘iston dexqonchilik ilmiy-tadqiqot instituti Ingichka tolali paxtachilik ilmiy-tadqiqot instituti Janubiy dehqonchilik ilmiy-tadqiqot instituti Don va dukkakli ekinlar ilmiy-tadqiqot instituti Lalmikor dehqonchilik ilmiy-tadqiqot instituti O‘simliklar genetik resurslari ilmiy-tadqiqot instituti Qishloq xo‘jaligini mexanizatsiyalash ilmiy-tadqiqot instituti Respublika ilmiy qishloq xo‘jaligi kutubxonasi Tolali ekinlar ilmiy-tadqiqot instituti Respublika agroxizmatlar markazi Qishloq xo‘jaligi sohasi kadrlarining malakasini oshirish va QTI
